Определение средней длины и средней молекулярной массы ДНК
Вычисление длины и молекулярной массы ДНК
Задача 103.
Вычислите массу (в граммах) двойной спирали ДНК, имеющей длину, равную расстоянию от Земли до Луны (384 000 км).
Решение:
молекулярная масса одного нуклеотида – 345 г/моль;
один шаг это полный виток спирали ДНК – поворот на 360 °С;
один шаг составляют 10 пар нуклеотидов;
длина одного шага – 3,4 нм;
расстояние между двумя нуклеотидами – 0,34 нм;
в 1 м = 109 нм;
в 1 км = 1011 нм;
384 000 = 384 . 1014 нм.
Тогда
Количество нуклеотидов в одной спирали ДНК будет составлять:
количество нуклеотидов = (384 . 1014)/ 0,34 = 112941176470588220 или 1,13 . 1017 шт.
масса 1 спирали ДНК будет сотавлять:
масса спирали ДНК = (1,13 . 1017) . 345 = 38964705882352935000 или 3,9 . 1019 г.
Отсюда
Масса ДНК = (3,9 . 1019) . 2 = 77929411764705870000 или 7,8 . 1019 г.
Ответ: 7,8 . 1019 г.
Задача 104.
В молекуле ДНК 30% гуаниловых нуклеотидов. Определите процентное содержание Ц, Т, А и длину молекулы ДНК, если в ней всего 600 нуклеотидов.
Решение:
В соответствии с принципом комплементарности количество Г равно количеству Ц, т.е. Г = Ц = 30%. Тогда их совместное количество: Г + Ц = 60%, а количество
А + Т = 100 - 60 = 40%, а в отдельности А = Т = 40 : 2 = 20%. Длина молекулы ДНК определяется количеством нуклеотидов в одной цепи (т.е. количеством пар нуклеотидов) умноженным на длину нуклеотида. В ДНК 600 нуклеотидов (шт.) или 300 пар, расстояние между соседними парами 0,34 нм, следовательно длина молекулы ДНК будет:
300 х 0,34 = 102 нм.
Ответ: Г = 30%, Ц = 30%, А = 20%, Т = 20%; длина ДНК 102 нм.
Задача 105.
Вычислите среднюю длину (в нанометрах) и среднюю молекулярную массу генов, координирующих: а) тРНК (90 мононуклеотидных остатков); б) рибонуклеазу (124 аминокислотных остатка); в) миозин (1800 аминокислотных остатков).
Решение:
Расстояние между двумя нуклеотидами – 0,34 нм;
молекулярная масса одного нуклеотида – 345 г/моль.
а) тРНК (90 мононуклеотидных остатков)
Ген, контролирующий тРНК, содержит в два раза больше мононуклеотидных остатков, значит, количество нуклеотидов будет 180 (90 • 2 = 180).
Тогда
Длина гена = 180 . 0,34 = 61,2 нм.
Средняя молекулярная масса гена = 180 . 345 = 62100 г/моль.
б) рибонуклеаза (124 аминокислотных остатка)
Каждую аминокислоту контролирует кодон, состоящий из трех нуклеотидов. Поэтому участок одной спирали ДНК будет состоять из 372 нуклеотидов (124 . 3 = 372), а ген, с учетом того, что ДНК состоит из двух спиралей, будет содержать 744 нуклеотида (372 . 2 = 744).
Тогда
Длина гена = 744 . 0,34 = 252,96 нм.
Средняя молекулярная масса гена = 744 . 345 = 256680 г/моль.
в) миозин (1800 аминокислотных остатков)
Каждую аминокислоту контролирует кодон, состоящий из трех нуклеотидов. Поэтому иРНК будет состоять из 5400 нуклеотидов (1800 . 3 = 5400), а ген, с учетом того, что ДНК состоит из двух спиралей, будет содержать 10800 нуклеотида (5400 . 2 = 10800).
Тогда
Длина гена = 10800 . 0,34 = 3672 нм.
Средняя молекулярная масса гена = 10800 . 345 = 3726000 г/моль.
Определение первичной структуры полипептида по кодирующей цепи ДНК
Задача 106.
На участке левой (условно) цепи ДНК нуклеотиды расположены в такой последовательности: АТАГТТАААТТТАЦА. Какую первичную структуру имеет полипептид, если кодирующей является правая цепь ДНК? Что произойдет с белком, если выпадет пятый нуклеотид?
Решение:
1. Первичная структура белка
1-я цепь ДНК: АТАГТТАААТТТАЦА
2-я цепь ДНК: ТАТЦААТТТАААТГТ
иРНК: АУА ГУУ ААА УУУ АЦА
полипептид: Иле-Вал-Лиз-Фен-Тре
2. Первичная структура полипептида после выпадения 5-го нуклеотида
2-я цепь ДНК: ТАТ ЦАТ ТТА ААТ ГТ
иРНК: АУА ГУА ААУ УУА ЦА
полипептид: Иле-Вал-Асп-Лей